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10組國內外高校團隊 展開“BT+IT”較量

2021-08-18 01:02:40

「本文來源:深圳商報」
【深圳商報訊】(記者張妍通訊員田嬌)8月16日,“數源杯”百萬單細胞基因表達數據算法大賽在深圳國家基因庫舉行決賽,來自國內外10所高校的10組精英團隊在此展開一場關于“BT+IT”的較量。
據了解,該賽事由深圳國家基因庫主辦,深圳華大生命科學研究院、深圳市猛犸公益基金會、深圳市華大基因學院協辦,旨在提升單細胞聚類算法的性能。
深圳國家基因庫主任王韌表示,從2009年第1篇單細胞轉錄組測序文章橫空出世至今,短短10余年間單細胞測序技術在生命科學研究各層面都獲得了快速、廣泛的應用,單細胞測序技術的發展也日新月異。“隨著單細胞數據的不斷產出,數據處理的通量不斷攀升,這意味著單細胞計算工具的性能也需要不斷提升,方能滿足該領域飛速發展的需求。”
深圳國家基因庫生命大數據平臺負責人魏曉鋒表示,深圳國家基因庫本身就是以生命大數據和大樣本存儲為根基的國家基因庫,希望以舉辦該賽事為契機,讓更多領域的科研人員更好地利用相關資源,更好地挖掘相關信息。該賽事吸引了全球300余支隊伍報名參與,累計提交作品達1819件次,最終經過初賽、復賽的嚴格評審篩選,10支隊伍入圍決賽。
“我們最終目的是希望推動應用,比如精準醫學、精準農業育種等。”魏曉鋒表示,該賽事產生的算法工具將部署到生命大數據平臺上,免費提供給醫療機構和科研機構人員使用。
BT指的是生物技術,IT則是信息技術,“BT+IT”的融合則可能是下一個產業的爆發點。華大集團首席科學家、華大生命科學研究院院長徐訊在賽事發言中透露,科技部的“十四五”重點研發計劃上已啟動了“BT+IT”融合項目。
徐訊認為,“BT+IT”融合包括兩方面內容,一是利用生物技術來突破信息技術的局限。目前,沒有任何一種存儲介質可以像DNA一樣把信息儲存上百萬年的時間,如果用AGCT4種堿基字符作為編碼來取代計算機存儲格式,存儲年限將遠超過目前的磁介質和光介質。二是利用信息技術解決生物技術的問題,“這就是今天比賽的內容之一,而這僅僅是一個開端。”

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